Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms