Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kndc1Q0KK55 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kndc1Q0KK55 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms