Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc21bQ0HA38 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms