Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Znf541Q0GGX2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms