Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc7a1Q09143 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms