Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
F13bQ07968 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
F13bQ07968 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
F13bQ07968 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
F13bQ07968 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms