Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf3Q07104 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms