Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah1bQ06985 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms