Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms