Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprgQ05909 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms