Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cacna1sQ02789 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1sQ02789 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1sQ02789 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms