Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uba1Q02053 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms