Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VcpQ01853 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VcpQ01853 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms