Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2cQ01098 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms