Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VegfaQ00731 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms