Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PgrQ00175 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms