Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms