Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AlkP97793 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AlkP97793 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AlkP97793 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AlkP97793 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AlkP97793 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
AlkP97793 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
AlkP97793 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AlkP97793 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
AlkP97793 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AlkP97793 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AlkP97793 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms