Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Frg1P97376 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms