Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Meis3P97368 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms