Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cct5P80316 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cct5P80316 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cct5P80316 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms