Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tp53bp1P70399 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tp53bp1P70399 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms