Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms