Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux2P70298 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux2P70298 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms