Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgif1P70284 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgif1P70284 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms