Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp7P70280 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp7P70280 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms