Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf6P70196 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms