Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd6P61407 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd6P61407 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms