Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf3P61205 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arf3P61205 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms