Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2iP60898 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2iP60898 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms