Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rin3P59729 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rin3P59729 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rin3P59729 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms