Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scarf2P59222 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scarf2P59222 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms