Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dpf3P58269 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms