Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpdl3bP58242 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms