Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms