Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdcd5P56812 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms