Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms