Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh11P55288 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh11P55288 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh11P55288 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms