Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pex2P55098 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms