Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acod1P54987 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms