Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ApodP51910 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ApodP51910 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms