Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CntfP51642 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CntfP51642 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CntfP51642 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CntfP51642 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CntfP51642 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CntfP51642 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CntfP51642 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CntfP51642 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CntfP51642 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CntfP51642 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms