Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XpcP51612 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XpcP51612 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XpcP51612 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XpcP51612 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XpcP51612 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
XpcP51612 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms