Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1swP51491 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms