Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa-rs12P50716 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms