Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx3P50481 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms