Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrprbP47758 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrprbP47758 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms