Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klf1P46099 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms