Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms