Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf9P41274 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms